为了更充分地发挥青年经济学者论坛在广大青年经济学者中的学术交流平台的作用，论坛的三家发起单位——中国社会科学院经济研究所/经济研究杂志社、北京大学光华管理学院、武汉大学经济与管理学院/高级研究中心，与全国多家财经商管类院校经过积极、认真、友好协商，共同决定于2012年9月21日成立首届青年经济学者论坛学术理事会（以下简称理事会）。全体理事会成员单位经讨论决定：每届理事会的届期为三年；每年在当届理事会成员单位举办一届青年经济学者论坛；理事会每年至少召开一次全体会议，会上各成员单位集体讨论有关青年经济学者论坛的各项重要议题并做出决定，其中包括：讨论并修正理事会章程，讨论并决定各届青年经济学者论坛的举办单位，以及是否同意其他单位申请加入理事会等。目前，第四届青年经济学者论坛学术理事会成员单位，除发起单位外，包括（以下按单位名称音序排列）：北京大学经济学院、北京师范大学经济与工商管理学院、东北财经大学、对外经济贸易大学国际经济贸易学院、复旦大学经济学院、湖南大学经济与贸易学院（2020年加入）、暨南大学经济学院、辽宁大学经济学院、南京大学经济学院、南开大学经济学院、清华大学五道口金融学院、山东大学经济研究院、西安交通大学经济与金融学院、西北大学经济管理学院、西南财经大学、厦门大学王亚南经济研究院/经济学院、浙江大学经济学院、中共中央党校经济学部（2016年加入）、中国科学院大学经济与管理学院（2016年加入）、中国人民大学经济学院、中国社会科学院大学商学院（2020年加入）、中南财经政法大学、中山大学岭南学院、中央财经大学